ChRD-PET(Chromatin-associated RNA-DNA interactions followed by paired-end-tag sequencing), 一种植物RNA-DNA互作▅研究技术,其主要原理是利用特异组蛋白修饰抗体,通过①染色质免疫共沉淀富集DNA-RNA-蛋白质复合→物,用一种生物素标记的DNA bridge linker,将复合物上空间接近的RNA和DNA进行连接,通过高通量测序获得DNA和RNA交∏互的数据。利用这一技术,研究人员构建△了水稻H3 ChRD-PET和H3K4me3 ChRD-PET数据,分别表征染色质结合RNA在全基因组上的结合位点,以及染色质结合RNA与H3K4me3修饰区域(标记水稻活跃启动子)的互作图谱。进一步系统地分析了RNA与染色质交互的基本特征。