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HiChIP
05-08
2022
HiChIP(in situ *Hi-C followed by chromatin immunoprecipitation)是一种利用原位∞Hi-C原理和转座酶介导构建文库来解析染色质构象的方法。该方法由Howard Chang实验室建立,相关方法论文在2016年11月份发表于 Nature Methods.
Hi-C
05-08
2022
Hi-C(High-throughput chromosome conformation capture),高通量染︽色质构象捕获技术研究全基因组范围内整个染色质在空间位置上的关系,获得高分∩辨率的染色质调控元件相互作用图谱,更加全面阐述染色质三维◣结构。同样,Hi-C 可以与 RNA-Seq、ChIP-Seq等多组学数据进行联合分析,进而从基因调控网络和表观ζ遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。
ChRD-PET
05-08
2022
ChRD-PET(Chromatin-associated RNA-DNA interactions followed by paired-end-tag sequencing), 一种植物RNA-DNA互作研→究技术,其主要原理是利用特异组蛋白修饰抗体,通过染色质免疫共沉淀富集DNA-RNA-蛋白※质复合物,用一种生物素标记的DNA bridge linker,将复卐合物上空间接近的RNA和DNA进行连接,通过高通量测序⌒获得DNA和RNA交互的数据。利用这一技术,研究人员构建了◤水稻H3 ChRD-PET和H3K4me3 ChRD-PET数据,分别表征染色质结合RNA在全基因↓组上的结合位点,以▃及染色质结合RNA与H3…
RIC-seq
05-08
2022
RIC-seq技①术具有重要的应用价值,可用于系统描绘细胞内全局RNA互作图谱,特别是増强子与启动子的互作网☉络,并◣揭示特定RNA的高级结构与作用靶标。在医学研究∴方面,利用RIC-seq 技术可系统分析基Ψ因突变对 RNA 高级结构和作用靶标的影响,揭示非编↘码区突变的致病机理,并为相关疾病▓的临床诊断和治疗奠定基础。在病毒研究方面,RIC-seq可用于病毒☆RNA的结▼构解析,为病毒感染的机制和开发抗病毒药物,也具有广阔的应用前景。RIC-seq技术的转♀化应用,将进一步丰富表观生物在医学表观遗传领域的…
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