HiChIP(in situ *Hi-C followed by chromatin immunoprecipitation)是一种利用原位Hi-C原理和转㊣ 座酶介导构建文库来解析染色质构象的方法。该方法由Howard Chang实验ω室建立,相关方法论文在□ 2016年11月份发表于 Nature Methods.
服务流程
1. 用甲醛铰链DNA和蛋白,目的是让可能存在相互影响的DNA片段连接;
2. 用超声等方法将DNA片段化;
3. 用特异性蛋白抗体富集DNA和蛋白复合物;
4. 在DNA片段末端加上包含MmeI位点的生物素化寡核苷酸linker;
5. 连接linker,从而形成〖连接目的DNA片段㊣ 的桥梁;
6. 用限制性内】切酶消化得到DNA片段,去除蛋白质;
7. 固定化PET序列;
8. 上机测序。
细胞样品
反应所需细胞应大于10million/管(每个样本准备2~3管),具√体细节详询销售。
动物组织
选取新鲜组织,质量大于100mg/份,取样时剔除冗余★部分,保证组织的单一性,建议取材后用生理盐水漂洗※,以去除≡血渍和污物,液氮速冻,-80℃保存。建议样品▅制备 2~3 份。
植物组织
选取取幼嫩组◎织,如嫩叶,根尖,幼苗等,质量大于5g/份,建议取样后用清水漂洗去除污⊙物,纸巾吸干水分后液氮速冻,-80℃保存。建议样品制』备 2~3 份。
具体细节,详询销售或々技术人员。