RNA测序（RNA-seq）是转录组学研究的重要工具，也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量→的局限性，转录组学有以下优势：1）能够动态考察细胞基因组的表↙达，多维度地反映差异变化；2）可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA，研究其结构以及在细胞生命活动中的重↑要调控作用；3）与蛋白∞组学研究相互补充，更全面地呈现细胞水平的变化信息。作为转录组学研究的技术基础，RNA测序技术也在不断地更新迭代。

RNA-seq（RNA sequencing [1]）即转录组测序※技术，就是用高通量测⌒序技术进行测序分析，反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平。在过∑　去的十年中，RNA-Seq技术迅速发展，并成为了在转录组水平上ζ分析差异基因表达/mRNA可〓变剪切的不可缺少的工具。随着下一代测序技♀术的发展，RNA-Seq技术应用范围变得更◣加广泛：一是在RNA生物学领域，RNA-Seq可以应用于单细胞基因表达/蛋【白质表达/RNA结构卐的分析「※；二是空间转录组的概念也逐渐兴起。长读长/直接RNA-Seq技术以及更好的数据分▆析计算工具有助于生物学家们利用RNA-seq加深对RNA生物学的理解——例如转录何时√何地开始；体内折叠和分子间作用如何◆影响RNA功能★等问题.